MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 10803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015422	GCG	2	6	4635687	4635692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_015422	GC	3	6	4635801	4635806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_015422	CTGC	2	8	4635837	4635844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_015422	GCC	2	6	4635856	4635861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_015422	TGC	2	6	4635878	4635883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_015422	CGG	2	6	4635900	4635905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_015422	GCGG	3	12	4635902	4635913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_015422	GCG	2	6	4635931	4635936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_015422	CGC	2	6	4635982	4635987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_015422	TCGC	2	8	4636005	4636012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_015422	CGA	2	6	4636013	4636018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_015422	GCTG	2	8	4636022	4636029	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10013	NC_015422	CTG	2	6	4636053	4636058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_015422	TCA	2	6	4637901	4637906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_015422	CAA	2	6	4637934	4637939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_015422	GGCCC	2	10	4641789	4641798	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10017	NC_015422	CCG	2	6	4641799	4641804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_015422	CGT	2	6	4641815	4641820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_015422	TAA	2	6	4643304	4643309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_015422	CGC	3	9	4643316	4643324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_015422	CAAA	2	8	4643340	4643347	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_015422	GC	3	6	4643357	4643362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_015422	GC	3	6	4643369	4643374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_015422	CG	3	6	4643390	4643395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_015422	GGTT	2	8	4644074	4644081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_015422	AAGG	2	8	4644100	4644107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_015422	CGGC	2	8	4644118	4644125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10028	NC_015422	GCC	2	6	4646525	4646530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_015422	GTG	2	6	4646563	4646568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_015422	CGG	2	6	4646570	4646575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_015422	CG	3	6	4646962	4646967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_015422	CAC	2	6	4648909	4648914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_015422	CCG	2	6	4648942	4648947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_015422	GCC	2	6	4648990	4648995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_015422	GCC	2	6	4649003	4649008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_015422	CAC	2	6	4649045	4649050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_015422	CGA	2	6	4649060	4649065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_015422	CCAG	2	8	4653424	4653431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_015422	TTA	2	6	4653538	4653543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_015422	GCC	2	6	4655841	4655846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_015422	CAA	2	6	4655883	4655888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_015422	C	6	6	4658010	4658015	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10043	NC_015422	G	6	6	4658030	4658035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_015422	ATC	2	6	4658091	4658096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_015422	TCA	2	6	4658158	4658163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_015422	CGG	2	6	4658200	4658205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_015422	TGC	2	6	4658327	4658332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_015422	CGT	2	6	4658355	4658360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_015422	GT	3	6	4658505	4658510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_015422	ACG	2	6	4658589	4658594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_015422	GATGA	2	10	4658665	4658674	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_015422	CCG	2	6	4658697	4658702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10053	NC_015422	ACC	2	6	4658784	4658789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10054	NC_015422	CTC	2	6	4658903	4658908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_015422	GAG	2	6	4658922	4658927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_015422	GGT	2	6	4659007	4659012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_015422	CAC	2	6	4659044	4659049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_015422	CAT	2	6	4659150	4659155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_015422	AGG	2	6	4659184	4659189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_015422	GCC	2	6	4659277	4659282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_015422	TCAA	2	8	4659296	4659303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_015422	CAT	2	6	4659316	4659321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_015422	TTA	2	6	4659392	4659397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_015422	T	6	6	4659416	4659421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_015422	TC	3	6	4659519	4659524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10066	NC_015422	GTC	2	6	4659574	4659579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_015422	TCAC	2	8	4659619	4659626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_015422	CGG	2	6	4659668	4659673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_015422	GAC	2	6	4660052	4660057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_015422	CTTT	2	8	4660078	4660085	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10071	NC_015422	ATG	2	6	4660088	4660093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_015422	GCT	2	6	4660094	4660099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_015422	GTT	2	6	4660183	4660188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_015422	TTGGT	2	10	4660263	4660272	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_015422	GA	3	6	4660351	4660356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_015422	GTTT	2	8	4660372	4660379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_015422	CTCCC	2	10	4660668	4660677	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10078	NC_015422	GAT	2	6	4660724	4660729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_015422	GGA	2	6	4660744	4660749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_015422	C	6	6	4660754	4660759	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10081	NC_015422	ACC	2	6	4660810	4660815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10082	NC_015422	GGCC	2	8	4660851	4660858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10083	NC_015422	TCGC	2	8	4660912	4660919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_015422	ACT	2	6	4660921	4660926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_015422	GGGT	2	8	4661027	4661034	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_015422	TCG	2	6	4661109	4661114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_015422	ATC	2	6	4661118	4661123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_015422	CCA	2	6	4661134	4661139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_015422	GCC	2	6	4661189	4661194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_015422	CG	3	6	4661230	4661235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10091	NC_015422	CAC	2	6	4661264	4661269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10092	NC_015422	CAC	2	6	4661276	4661281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_015422	CAC	2	6	4661371	4661376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_015422	AGC	2	6	4661470	4661475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_015422	GGT	2	6	4661518	4661523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_015422	GGA	2	6	4661524	4661529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_015422	CGA	2	6	4661544	4661549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_015422	C	6	6	4661591	4661596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10099	NC_015422	CTTC	2	8	4661606	4661613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_015422	TGG	2	6	4661626	4661631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_015422	CAA	2	6	4661755	4661760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_015422	AGG	2	6	4661804	4661809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_015422	CCG	2	6	4661870	4661875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10104	NC_015422	CCT	2	6	4661886	4661891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_015422	GT	3	6	4661945	4661950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_015422	GT	3	6	4662114	4662119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_015422	TCC	2	6	4662165	4662170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_015422	CACGA	2	10	4662259	4662268	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10109	NC_015422	GAC	2	6	4662272	4662277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_015422	GCA	2	6	4662284	4662289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_015422	CT	3	6	4662302	4662307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_015422	CAT	2	6	4662389	4662394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_015422	CAA	2	6	4662504	4662509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_015422	TCC	2	6	4662624	4662629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_015422	GCT	2	6	4662814	4662819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_015422	TTA	2	6	4662870	4662875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_015422	CTG	2	6	4662982	4662987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_015422	ATC	2	6	4663032	4663037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_015422	TCG	2	6	4663057	4663062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_015422	CCA	2	6	4663081	4663086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_015422	TCCG	2	8	4663111	4663118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_015422	CG	3	6	4663117	4663122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_015422	GCC	2	6	4663288	4663293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_015422	T	6	6	4663340	4663345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_015422	ACTTC	2	10	4663388	4663397	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10126	NC_015422	TCT	2	6	4663398	4663403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_015422	GAA	2	6	4663424	4663429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_015422	GAACCA	2	12	4663480	4663491	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_015422	TGC	2	6	4663514	4663519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10131	NC_015422	ACC	2	6	4663604	4663609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10132	NC_015422	CAG	3	9	4663613	4663621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_015422	CAAG	2	8	4663678	4663685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10134	NC_015422	TTTC	2	8	4663690	4663697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10144	NC_015422	CG	3	6	4673783	4673788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10236	NC_015422	AATC	2	8	4710149	4710156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10244	NC_015422	GGCGG	2	10	4711698	4711707	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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10248	NC_015422	ATG	2	6	4717413	4717418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_015422	A	7	7	4717429	4717435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_015422	GGAG	2	8	4717462	4717469	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_015422	GAG	2	6	4718569	4718574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_015422	GCG	2	6	4718578	4718583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_015422	CCG	2	6	4718599	4718604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_015422	ACCC	2	8	4718610	4718617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10255	NC_015422	CG	3	6	4718631	4718636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10256	NC_015422	GCG	2	6	4718671	4718676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10258	NC_015422	GCC	3	9	4721601	4721609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10385	NC_015422	T	7	7	4820198	4820204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10388	NC_015422	CT	3	6	4820364	4820369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10389	NC_015422	TTTCG	2	10	4820372	4820381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10390	NC_015422	T	6	6	4820397	4820402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10391	NC_015422	GCA	2	6	4820408	4820413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10392	NC_015422	GC	4	8	4820416	4820423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10393	NC_015422	GC	3	6	4820437	4820442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10394	NC_015422	CGC	2	6	4821096	4821101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10482	NC_015422	CG	3	6	4837654	4837659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10483	NC_015422	TC	4	8	4839745	4839752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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